Riparare il danno non è obbligatorio, come ti è già capitato puoi benissimo farti liquidare il danno stimato decurtato dell'iva (in assenza di fattura di riparazione quindi).
La proposta fatta in merito ad inizio anno dal governo non è andata in porto, alcune compagnie hanno questa condizione come aggiuntiva in cambio uno sconto sulla rca (andando ovviamene in carrozzerie convenzionate).

Quindi se il perito si è accorto per esempio che ci sia della ruggine nella parte danneggiata dall'auto, potrebbe valutare che il danno almeno pazialmente fosse antecedente al sinistro.
Questo ovviamente farebbe abbassare la stima del costo di riparazione, da qui la non copertura totale delle spese.

Per farmi capire meglio: con cai firmato e ragione nel sinistro, alcune compagnie a fronte di uno sconto sulla rca "obbligano" il proprio assicurato a far riparare il veicolo (se è suo desiderio ripararlo) in una carrozzeria di quelle indicate dalla compagnia stessa. Se si rivolgono altrove per la riparazione, c'è uno scoperto che verrà decurtato dalla somma fatturata.

Un saluto!